新纪元大学学院座落在雪兰莪州加影的华侨岗上，占地8.5英亩。
新纪元大学学院校地原属于加影华侨学校，1948年英殖民政府颁布紧急法令，华侨学校的校地被英军占用，一直到50年代独立后才归还。1974年华侨学校产业受托会（由加影八大注册团体，即育华校友会、乌冷广东会馆、乌冷客属公会、乌冷福建会馆、加影商矿公会、善余俱乐部、广东义山公会、民生体育会组织而成）将校地租予独立大学有限公司，作为创办独立大学的校址。
1989年10月1日，华侨学校产业受托会将校地捐献给独立大学有限公司，作为建立华文高等教育中心用途。1993年12月19日，独大独中加影行政楼落成，充作董总行政处之用。
1994年8月27日，董教总教育中心(非营利)有限公司正式将《新纪元学院申办书》呈予教育部。1997年5月28日获得教育部批准开办新纪元学院，同年10月28日获得雪州教育局批准注册。1998年3月1日学院举办第一届新生入学开课礼，第一批学生共148人，当时开设的科系有商学系、资讯工艺系及中国语言文学系。
在180多年漫长的马来西亚华文教育历史中，新纪元学院的创办可说是1980年南洋大学被关闭、1982年申办独立大学官司败诉后，华教的另一个新起点。至此，我国华社实现从小学、中学至大学完整母语教育体系的夙愿方得以露出曙光。
新纪元学院是由董教总教育中心(非营利)有限公司创办，由全国热心华文教育的人士集资建设而成的民办大专学府。1998年初开课时，由于空间不足，需要使用货柜箱上课。一直到2001年9月教学大楼及饮水思源宿舍大楼落成启用后，学院空间使用问题才获得解决。
当学院于1997年正式获准开办，以“筹募新纪元学院建设与发展基金”为名义的筹款运动在全国如火如荼展开。当时更扩大原有的建筑物规模，决定兴建教学楼及饮水思源宿舍楼。1999年正式动土，2001年年底竣工。
新院两座大楼庞大的建设经费主要是在董总领导下，全面动员全国各地区热心华教人士，有钱出钱、有力出力，一点一滴累积出来的。多姿多彩的筹款活动在各地迅速展开，通过主办义卖会、慈善晚宴、义走、义踏、慈善义演等；也通过各项运动如百万献华教、售卖金章、银章运动、以课室命名等方式，多方筹集建设基金。
2001年更成立筹募新纪元学院建设与发展基金槟城州工委会及霹雳州百人工委会，有规模、有系统的在地方上发动筹款，成绩斐然。北马人民连同南马等地如柔佛、马六甲、森美兰等州的人民，在全国汇成一股浪潮，通过筹款让建设学院的深远意义深入民心。做到“全力筹款、超越筹款”，真正发挥了群众齐心协力兴办民族高等学府的巨大决心与力量。
1997年5月28日
1998年3月1日
第一任院长为洪天赐博士 (1998年至2000年9月30日)
2001年
第二任院长为柯嘉逊博士 (2000年10月1日至2008年12月31日)
2002年
2002年7月21日:
721华教盛会-大楼落成开幕典礼 。
扩大社区关怀—出版社区报《观察家》。
拓展学术研究—成立学术研究中心。
2004年
图书馆迁馆暨新馆开幕仪式。
陶艺室落成，开辟同学创作空间。
2005年
商业与行政系、资讯工艺系、中文系、媒体研究系和美术与设计系增设大学先修班（PRE-U）以及2+1/2+2副学士班（ASSOCIATE DEGREE）两项新课程。
新辅导中心正式启用，辅导系统趋完善。
2006年
创办辅导与咨商心理学系，塑造人文关怀的学习氛围。
2009年
(2009年1月15日至2011年12月31日)
2012年
（2012年1月1日迄今）
2014年
2014年9月5日, 陈六使图书馆
陈六使铜像揭像仪式,命名为陈六使图书馆。
南洋大学史料中心开幕仪式。
2015年
2015年5月30日 , 陈六使图书馆
方修文库揭幕礼。
2016年
2016年12月30日，新纪元获得高等教育部批准由学院升格为大学学院。
2017年
2017年4月8日
新纪元大学学院正式宣布，新纪元在升格后开办共9项新的学士学位课程。
2017年9月24日，陈六使图书馆
李业霖书库揭幕礼暨陈六使研究所系列讲座之“我的藏书与治学之路”
2018年
2018年4月15日
新纪元完美教学楼开幕
2018年5月26日
20周年校庆典礼
2018年7月28日
《马新慈善家》推介礼
2018年11月11日
新纪元20周年筹款晚宴
2018年12月8日，陈六使图书馆
李锦宗马华文学史料馆揭幕礼
2019年
政府特别拨款仪式
2019年3月31日，陈六使图书馆
杨进发书库揭幕礼。
4月1日起成立国际教育学院，国际交流处及国际学生事务处将并入国际教育学院
华教200周年系列活动：
*天津滨海浪花艺术团系列义演
*何灵慧导演音乐剧20周年慈善演唱晚宴
*东南亚华人与新文化运动国际学术研讨会
马来西亚乐坛史上第一张由校方全力资助的校园民歌专辑——《起飞》
第一届中华研究及东盟研究硕博课程开课
“浓情厚意献华教” 世界总统葡萄酒外交筹款
2020年
1月1日起电脑科学与资讯工艺系提升为 “电脑科学与资讯科技学院”
1月1日起“商业与资讯工艺学院”易名为“会计，管理与经济学院”
6月1日起成立乐龄服务与管理学院
6月16日起注册处（教务组）易名为注册处（课务组）
6月16日起在国际教育学院底下成立语言与跨文化中心
6月16日起招生处易名为市场与行销部
7月25日
2020年7月份硕博留学生开课礼
8月1日起政府事务处易名为政府事务与课程认证处
致力于把新纪元大学学院发展成为世界级的民办高等学府。
多元开放，成人成才；源自社会，回馈社会。
新纪元大学学院校徽| 图案 | 形象 | 意义 |
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三面迎风向上飘扬的旗帜。 | 代表积极、进取、向上、开朗、尊重及开放的态度。 |
| 三种丰富且鲜明的彩色（黄、红、蓝）。 | 三者，代表多元。不同的颜色组合，象征多元精神及民主活力。 | |
| 英文大写字母“E”的抽象形象。 | 代表新纪元（NEW ERA）中ERA的涵义。 | |
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英文大写字母“N”的抽象形象。 | 代表新纪元（NEW ERA）中NEW的涵义。结合N（NEW）及E（ERA），成为新纪元学院（NEW ERA）N.E.的缩写。 |
| 由三块面组成的“N”作为三面旗帜的支撑点 | 三块面代表： 新精神 – 自由精神 新思想 – 独立思想 新时代 – 多元时代 |
