新纪元大学学院座落在雪兰莪州加影的华侨岗上，占地8.5英亩。

新纪元大学学院校地原属于加影华侨学校，1948年英殖民政府颁布紧急法令，华侨学校的校地被英军占用，一直到50年代独立后才归还。1974年华侨学校产业受托会（由加影八大注册团体，即育华校友会、乌冷广东会馆、乌冷客属公会、乌冷福建会馆、加影商矿公会、善余俱乐部、广东义山公会、民生体育会组织而成）将校地租予独立大学有限公司，作为创办独立大学的校址。

1989年10月1日，华侨学校产业受托会将校地捐献给独立大学有限公司，作为建立华文高等教育中心用途。1993年12月19日，独大独中加影行政楼落成，充作董总行政处之用。

1994年8月27日，董教总教育中心(非营利)有限公司正式将《新纪元学院申办书》呈予教育部。1997年5月28日获得教育部批准开办新纪元学院，同年10月28日获得雪州教育局批准注册。1998年3月1日学院举办第一届新生入学开课礼，第一批学生共148人，当时开设的科系有商学系、资讯工艺系及中国语言文学系。

在180多年漫长的马来西亚华文教育历史中，新纪元学院的创办可说是1980年南洋大学被关闭、1982年申办独立大学官司败诉后，华教的另一个新起点。至此，我国华社实现从小学、中学至大学完整母语教育体系的夙愿方得以露出曙光。

新纪元学院是由董教总教育中心(非营利)有限公司创办，由全国热心华文教育的人士集资建设而成的民办大专学府。1998年初开课时，由于空间不足，需要使用货柜箱上课。一直到2001年9月教学大楼及饮水思源宿舍大楼落成启用后，学院空间使用问题才获得解决。

当学院于1997年正式获准开办，以“筹募新纪元学院建设与发展基金”为名义的筹款运动在全国如火如荼展开。当时更扩大原有的建筑物规模，决定兴建教学楼及饮水思源宿舍楼。1999年正式动土，2001年年底竣工。

新院两座大楼庞大的建设经费主要是在董总领导下，全面动员全国各地区热心华教人士，有钱出钱、有力出力，一点一滴累积出来的。多姿多彩的筹款活动在各地迅速展开，通过主办义卖会、慈善晚宴、义走、义踏、慈善义演等；也通过各项运动如百万献华教、售卖金章、银章运动、以课室命名等方式，多方筹集建设基金。

2001年更成立筹募新纪元学院建设与发展基金槟城州工委会及霹雳州百人工委会，有规模、有系统的在地方上发动筹款，成绩斐然。北马人民连同南马等地如柔佛、马六甲、森美兰等州的人民，在全国汇成一股浪潮，通过筹款让建设学院的深远意义深入民心。做到“全力筹款、超越筹款”，真正发挥了群众齐心协力兴办民族高等学府的巨大决心与力量。